Les fondateurs du groupe, les jumeaux Joel et Benji Madden, ont grandi dans la ville de Waldorf dans le Maryland. Ils ont fondé le groupe en 1996 avec leurs amis d’enfance Paul Thomas (basse) et Aaron Escolopio (batterie) après un déménagement à Annapolis ils rencontrèrent Billy Martin qui, comme eux, écoutait le groupe Silverchair.
De nombreux passages à l’antenne de stations de radio comme WHFS ou celle de Philadelphie et des concerts avec des groupes comme Blink 182, Lit, Eve 6, Nine Days et Bad Religion les ont finalement menés à un contrat avec Epic Records, qui fit paraître l’album du même nom que le groupe en 2000. Une chanson, « The Click » a été utilisée pour les séries animées de MTV. C'est à ce moment que le groupe a enchaîné ses premiers succès tel que Little Things

Escolopio quitte le groupe tôt en 2001 pour rejoindre le groupe Wakefield avec son frère. Il est remplacé par Dusty qui quitte le groupe avant la sortie du deuxième album, The Young & the Hopeless. C’est finalement Josh Freese qui jouera sur cet album. Grâce à la chanson Lifestyles of the rich and the famous, Good charlotte va être reconnu sur la scène rock internationale
La présence des deux frères Madden comme présentateurs sur MTV dans l’émission « All Things Rock » a beaucoup aidé à faire valoir leur musique à un plus haut rang. Finalement, « The Young & the Hopeless » est un succès majeur dont sont issus 5 singles.
Les Madden ont également monté un label appelé DC Flag ainsi qu’une marque de vêtements, MADE avec leur frêre aîné. Le guitariste Billy Martin a aussi lancé une ligne de vêtements: Level 27.

Good Charlotte est un groupe dont la crédibilité au sein de la scène punk est très contestée. Beaucoup de fans du genre punk leur reprochent leurs apparitions sur MTV ainsi que leurs lignes de vêtements et leur label qui contrastent fortement avec l’état d’esprit punk, le DIY (do it yourself) qui est la base de la mentalité punk. Les fans du groupe pensent que Good Charlotte ne devrait pas être exempt de succès uniquement sous prétexte que le groupe ne respecte pas certaines règles fondées 25 années plus tôt. C’est un débat qui semble insoluble et la réponse diffère pour chaque personne selon sa propre définition de la musique punk. Le groupe se définissant lui même comme un groupe de musique, mais ne s'engageant pas le moins du monde sur le genre de musique qu'ils jouent.

En 2004, Good Charlotte a enregistré son dernier album, The Chronicles of Life and Death dont les chansons relatent des choses qu'ils ont vécues. La dernière chanson, "Wounded", chantée par Benji Madden, est dédiée au père Madden qui a quitté sa famille alors que les jumeaux n'étaient qu'enfants.

Les Good Charlotte sortiront leur nouvel album le 19 mars 2007 et sera intitulé "Good Morning Revival" . Ce sera un retour au racines du groupe d'après Benji. Les deux premiers singles étant "Keep Your Hands Off My Girl" et "The River".