Pour comprendre l'histoire de Tool, il est important de connaître l'histoire de leur chanteur, Maynard James Keenan. Il fut élevé dans une famille baptiste assez stricte dans l'Ohio et entra dans l'armée en 1982, à l'école préparatoire de West Point (dont le code d'honneur était : "Je ne mentirai pas, ne tricherai pas, ne volerai pas, et ne tolérerai pas ceux qui le feront"), entre 1983 et 1984, et alla au "Kendall College of Art & design". Et comme-ci ce n'etait pas assez pour l'inciter a devenir enragé, il fut également violé par son beau-père. Il essaya d'ailleurs de communiquer son sentiment a propos de ses évènements dans "Prison Sex". Après avoir quitté son service, il alla à Los Angeles où son ami Adam Jones le convainquit de se lancer dans la musique.

Peu de temps après, ils commencèrent à écrire des chansons et à chercher une section rythmique. Paul D'Amour accepta rapidement de devenir le bassiste de Tool, et le voisin de Keenan, Danny Carey, devint leur batteur. En avril 1991, la construction du groupe était complète, et avant la fin de l'année, Zoo Records les signèrent. Contrairement à beaucoup de jeunes groupes, Tool insista sur les termes du contrats afin d'avoir un contrôle complet sur chaque album et chaque vidéo. En mars 1992, ils enregistrèrent "Opiate", un album de sept chansons très sombres. Il tournèrent quelques temps et en 1993, leur 2e opus "Undertow" sort et deviendra album de platine en 1994. Pour ceux qui se demanderaient encore ce que représente la pochette du CD, c'est en fait une sculpture d'Adam Jones. D'ailleurs, e clip de "Sober", réalisé par Jones, qui est plus un spécialiste des effets spéciaux qu'un musicien à la base, lui permit de remporter les MTV Video Awards grâce aux superbes SFX employés. C'est le festival Lollapalooza, en 1993, qui leur servit à montrer au monde entier leur puissance scénique hors du commun. Et c'est à la fin de l'année que Tool conquit l'Europe en tournant avec Fishbone et Rage Against The Machine.

En septembre 1995, Tool part en Australie pour le Alternative Nation Music Festival, et la composition du groupe y change : le bassiste Paul D'Amour quitte le groupe en de bons termes pour divergences artistiques, avant de former son propre groupe, Lusk. Justin Chancellor, alors membre de Peach, qui joua en 1ère partie de Tool en 1994, décide de rejoindre la formation de Keenan. En mai 1996, Tool retourna donc en studio pour enregistrer "Aenima". Le producteur des 2 premiers albums de Tool, Sylvia Massy, fut remplacé par King Crimson pour cet album. L'album sorti en octobre 1996, propulsa Tool au n°2 du classement général des CD aux States.

Tool sort ensuite Lateralus en 2001, entretemps, Keenan créa A Perfect Circle aux côtés de Billy Howerdel (qui travailla notamment pour les Smashing Pumpkins) et a remporté un succés mondial avec les albums "Mer de Noms" et "13th Step".
C'est après 5 ans d'absence que Tool revient sur le devant de la scène avec "10,000 Days".